Platform Metabolism Metabolom/Chain UPLC TOF Pmm

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Device
Uplc_tof.jpg

Pilot process
Keywords
Organisation
Latitude
48.7114
Longitude
2.16828


Le LC MS TOF

C'est le couplage chromatographie liquide (UPLC ou HPLC) et spectromètre de masse à temps de vol (TOF). Sur la plateforme nous utilisons un UPLC


La chromatographie liquide

La chromatographie liquide permet de séparer les molécules suivant leur affinité aux différentes phases. Phase stationnaire et phase mobile.

Le détecteur à barrette de diode (PDA) permet de détecter les métabolites.

  1. UPLC de la plateforme

Le spectromètre de masse

La source est de type électrospray. Le spectromètre de masse identifie les métabolites par calcul du temps de vol de chaque molécule. Le temps de vol permet de calculer la masse exacte d'un composé par rapport au temps qu'il met pour voler dans le tube de vol.

  1. TOF de la plateforme

Les métabolites analysés

Par ce couplage, on identifie deux types de composés:

Des métabolites connus:

On identifie un métabolite par:

  • le temps de rétention
  • sa masse exacte
  • Le massif isotopique

Des métabolites inconnus:

On peut avoir la masse exacte puis effectuer une comparaison par rapport au massif isotopique. La valeur sigma permet l'identification avec le massif isotopique. La recherche dans des bases de données permet d'identifier des métabolites par comparaison avec des métabolites témoins.

Quelques métabolites identifiés par la plateforme:

  • Uracil
  • Nicotinamide
  • Acide Nicotinique
  • Ornithine
  • Quinolinic acid
  • Citrulline
  • Glutathion Reduit
  • UMP
  • NaMN
  • AMP
  • AdoHcy
  • SAM
  • UDP
  • ADP
  • Acide Folique
  • UTP
  • ATP
  • UDPglc
  • ADPglc
  • Glutathion Oxydé
  • NAD
  • NaAD
  • NADP
  • Fructose
  • Saccharose